Niet pochýb o tom, že mikroskopické vodné bezstavovce známe ako tardigrades, machové prasiatka alebo vodné medvede sú divné. Mimoriadne rozkošný tvorcovia môžu prežiť vákuum vesmíru, vydržať vysychanie suchom a po zmrazení sa objaviť nažive, okrem iných výkonov. Nedávna štúdia naznačuje, že tardigrades sú tiež génovými zlodejmi - že ich genómy držia viac DNA z nepríbuzných rastlín, baktérií a iných mikróbov ako ktorékoľvek iné zviera na Zemi, Rachel Nuwerová nedávno informovala o Smithsonian.com . Vedci naznačujú, že táto schopnosť môže dokonca vysvetliť, prečo sú tardigrades tak odolné.
Ale asi týždeň po oznámení tohto prekvapivého objavu ďalšia skupina spochybnila tieto zistenia, píše Ed Yong pre Atlantický oceán . Rýchle prepínanie medzi oboma tímami demonštruje, ako citlivá a potenciálne samoopravná veda môže byť v digitálnom veku.
Prvá štúdia od tímu so sídlom na Univerzite v Severnej Karolíne uviedla, že jeden druh tardigrade má neuveriteľných 6 600 génov, ktoré pôvodne patrili organizmom z iných kráľovstiev - väčšinou baktérií, ale aj húb, rastlín, vírusov a archaea a získaných prostredníctvom proces nazývaný horizontálny prenos génov. Tieto nálezy znamenali, že genóm Hypsibius dujardini je zložený z asi 17, 5% cudzej DNA, uviedol tím v Proceedings of the National Academy of Sciences . Pretože niektoré cudzie gény sú zapojené do stresových reakcií iných organizmov, vedci majú podozrenie, že by mohli mať tardigrades s niektorými svojimi vlastnými jedinečnými schopnosťami zvládať extrémne podmienky počasia.
Druhá skupina z University of Edinburgh však sekvenovala tie isté druhy tardigrade a získala veľmi odlišné výsledky. Tí vedci zistili, že zviera má medzi 36 a 500 horizontálne prenesenými génmi - oveľa menšie percento. Keď vyšla správa UNC, výsledky z Edinburghu boli ešte neuverejnené, ale vedci sa snažili zverejniť svoje zistenia na serveri pre predtlačový papier bioRxiv.org - na webovej stránke, na ktorej môžu byť rukopisy uverejnené skôr, ako sa odošlú do denníka a preskúmania typické pre vedecký výskum.
Skupina Edinburghu má podozrenie, že skupina UNC mohla mať „sekvencovanú DNA z baktérií, ktoré žili spolu s tardigradmi, a napriek ich najlepšiemu úsiliu si pomýlila gény týchto mikróbov za skutočné tardigrade gény“, píše Yong. Ako sa však mohla pomýliť prvá skupina, ak naozaj sú? Yong vysvetľuje, že technológia na sekvenovanie genómov zahŕňa nasekanie DNA na malé kúsky a potom zostavenie bitov do súvislého obrazu. Niektoré kontaminácie sa môžu ľahko dostať dovnútra, takže vedci sa snažia zistiť, ktoré kúsky patria organizmu, ktorý študujú, a nie mikróby v okolí.
Skupina Edinburghu si uvedomila, že niektoré fragmenty DNA boli v porovnaní s inými fragmentmi zriedkavé. „Neexistuje spôsob, ako by mohli byť biologicky súčasťou toho istého genómu, “ hovorí Yong vedúci tímu Mark Blaxter. Skupina dospela k záveru, že v tardigradeovom genóme je 500 génov, ktoré mohli pochádzať z iných zdrojov, ale majú len presvedčivé dôkazy o 36 z nich. To dáva tardigrade omnoho typickejší podiel cudzej DNA pre zviera.
V komentári k najnovšiemu článku Thomas Boothby a Bob Goldstein z UNC poukazujú na to, že si boli vedomí tohto potenciálneho problému a usilovne pracovali, aby to neovplyvnilo ich výsledky - ale že vždy existuje možnosť chyby. Dodávajú, že pred ďalším komentárom vykonajú ďalšiu analýzu. Vedci tiež uviedli, že ocenili rozhodnutie svojich súperov zverejniť svoje protichodné výsledky tak rýchlo na bioRxiv.org .
Pocity boli vzájomné. Sujai Kumar z edinburského tímu povedal Yongu, že keby skupina OSN nezverejnila svoje údaje okamžite, bolo by to pre ich skupinu náročnejšie. „Je zrejmé, že úžasná nová vedecká schopnosť sa rýchlo napraviť, “ hovorí Blaxter Yong. To, čo by v tomto prípade trvalo iba deväť dní, by v minulosti trvalo mesiace.
Porota zatiaľ zatiaľ zisťuje, koľko genómu tardigradu pochádza z cudzích zdrojov. Ale aj keď tieto malé stvorenia nie sú génovými zlodejmi, môžu byť na chvíľu hlavnými zlodejmi.
Poznámka redaktorov: Tento článok bol editovaný Rachel Nuwerovou, ktorá pôvodne informovala o výskume tardigrade pre Smithsonian.com.
